موسسه آموزش عالی خردگرایان مطهر در سال 1385 به عنوان مؤسسه آموزش عالی غیردولتی غیر انتقاعی با کسب مجوز از وزارت علوم، تحقیقات و فنآوری فعالیت خود را آغاز نمود. هیات مؤسس را جمعی از اساتید  دانشگاه  فردوسی  مشهد  تشکیل می دهند که با تجارب مدیریت اجرایی در دانشگاه، صنعت و بینش علمی و آموزشی در مسیر پیشبرد اهداف آموزش عالی کشور گام بر می دارند.